1、禽流感一般为白色、乳白色豆腐渣样分泌物，一般无弹性，容易碎，一碰即掉；大肠杆菌多为黄色、黄白色纤维素性分泌物，有弹性。
2、禽流感引起的包心包肝以及气囊炎、腹膜炎无味或轻微的腥臭味，肝脏多为颜色变浅，有的伴有出血点；大肠杆菌打开腹腔后有一股刺鼻的恶臭味，甚至不解剖就可以闻到，尤其是包心，包肝，伴有气囊炎，腹膜炎更为明显，肠系膜粘连甚至有未吸收的卵黄，常表现或深部可见到灰色肿瘤、肿胀，质硬。
3、禽流感一般呼吸道发病较快，未出现包心包肝病变时也可能先有气囊炎、腹膜炎病变；大肠杆菌一般与支原体混合感染时才会出现明显的气囊炎，腹膜炎病变，病程较长，常常为继发感染；
4、禽流感一般气管内弥漫性出血（新城疫为出血点）。有乳白色，豆腐渣样、干酪样物堵塞或泡沫状的物质堵塞。大肠杆菌、支原体混合感染气管内环状出血，有粘液。禽流感还会出现类支气管病变的单侧堵塞，堵塞物为颜色较浅的白色、乳白色柱状物或液体；支气管炎堵塞物发黄。
5、禽流感头部皮下有胶冻样液体，呈黄色或紫色，严重者颅骨也有出血现象；而败血型大肠杆菌很少有神经症状和头部症状，脑炎型大肠杆菌一般是小脑水肿出血。
6、禽流感伴有个别肿脸，流眼泪的症状；大肠杆菌很少有这种症状，眼炎型大肠杆菌零星也可发病，但传染较慢。
7、禽流感死亡较快，整齐度差的鸡容易发病，多发于21日龄防疫后及32日龄之前。死亡鸡只一般较好看，为偏中等或大个的。大肠杆菌包心包肝如果不是混合感染，一般为慢性消耗性死亡，死亡鸡只多为病程较长，爪子发干，较瘦的脱水鸡。
8、禽流感十二指肠出血较明显，在肉鸡上可表现小肠前段（空肠）有圆形凹陷的绿豆大小的出血片；大肠杆菌则为卡他性炎症。
9、禽流感采食量下降较明显，严重的可下降30-50%；大肠杆菌一般采食量不降或轻微降料。